编辑/绿萝
6 月 6 日,Ultima Genomics, Inc. 公布了与 NVIDIA 的合作,该合作将在 DNA 测序和分析过程的多个阶段利用 AI 加速分析。合作包括使用 NVIDIA GPU 进行光度测量和碱基调用的深度学习,并将很快包括加速变异调用。
在过去五年中,Ultima Genomics 开发了一种全新的测序架构,旨在超越传统方法,包括完全不同的流式细胞工程(flow cell engineering)、测序化学和机器学习。Ultima 目前正处于 UG 100™ 的早期访问计划中,这是其第一台使用这项新技术的高通量下一代测序 (NGS) 仪器,使客户能够以 1美元/Gb 的成本生成高质量的测序数据。
基因组学遇上人工智能
Ultima 仪器利用 NVIDIA A30 GPU 和 NVIDIA Clara AI 计算平台,为想要大规模运行基因组分析的客户提供高度准确和加速的初级和二级分析。Ultima 已单独宣布建立合作伙伴关系,为 Google 的 DeepVariant 开发 Ultima 特定的种系变体调用管道。这些自定义模型可以在 NVIDIA Clara Parabricks 中运行,从而加速这些和其他应用程序以进行二次分析。
「Ultima 的使命是不断扩大基因组信息的规模。」Ultima Genomics 首席执行官 Gilad Almogy 说,「我们独特的架构通过结合多种技术进行扩展,因此我们很高兴与 NVIDIA 合作,利用他们的 GPU 和 AI 加速平台来支持高质量的排序和加速计算,从而降低客户的总拥有成本。」
「NVIDIA 解决方案旨在加速大容量数据处理,我们与 Ultima 的合作在多个层面证明了这一点。」NVIDIA 基因组学联盟全球总监 George Vacek 说,「NVIDIA GPU 在 UG 100 中提供了高度的板载计算能力,并且可以通过 Clara Parabricks 在下游加速数据分析,通过更高吞吐量和更低成本的分析实现大规模数据计划。」
NVIDIA Clara Parabricks 计算管道采用 NVIDIA 的 CUDA、HPC、AI 和数据分析堆栈,为初级、二级和三级分析提供 GPU 加速库、管道和参考应用程序工作流。现成的解决方案与工具包相结合,以支持新的应用程序开发,以满足高通量基因组实验室快速发展的需求。
关于 Ultima Genomics
Ultima Genomics 正在大规模释放基因组学的力量。公司的使命是不断扩大基因组信息的规模,以实现生物学的前所未有的进步和人类健康的改善。随着人类处于生物革命的风口浪尖,几乎无休止地需要更多的基因组信息来解决生物学的复杂性和动态变化,并且进一步需要挑战传统的下一代测序技术。Ultima 革命性的新测序架构降低了测序成本,以帮助克服科学家和临床医生被迫在使用基因组信息的广度、深度和频率之间做出权衡。新的测序架构旨在远远超越传统的测序技术,降低基因组信息的成本,并促进 21 世纪基因组学的下一阶段。
要了解更多信息,请访问:www.ultimagenomics.com
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